Nima uchun biz Sanger sekvensiyasidan foydalanamiz?
Nima uchun biz Sanger sekvensiyasidan foydalanamiz?

Video: Nima uchun biz Sanger sekvensiyasidan foydalanamiz?

Video: Nima uchun biz Sanger sekvensiyasidan foydalanamiz?
Video: Начните сетевой бизнес легко и правильно!/Tarmoqli Biznesingizni yengil va to'g'ri boshlang! 2024, Noyabr
Anonim

Sanger ketma-ketligi namunalarning umumiy soni kam bo'lganda variantni skrining tadqiqotlari uchun samarali yondashuv hisoblanadi. Namuna soni yuqori bo'lgan variant skrining tadqiqotlari uchun amplikon ketma-ketlik NGS bilan yanada samarali va tejamkor.

Xuddi shunday, siz so'rashingiz mumkin: Sanger sekvensiyasining maqsadi nima?

Sanger ketma-ketligi in vitro DNK replikatsiyasi jarayonida zanjirni tugatuvchi dideoksinukleotidlarning DNK polimeraza tomonidan tanlab qo'shilish jarayonidir; SNVlarni aniqlashning eng keng tarqalgan usuli hisoblanadi.

Shuningdek, bilingki, nima uchun ddNTPlar Sanger ketma-ketligida ishlatiladi? Dideoksinukleotidlar ning zanjir cho‘zuvchi ingibitorlari hisoblanadi DNK polimeraza, ishlatilgan ichida Sanger uchun usul DNK ketma-ketligi . Shunday qilib, bu molekulalar dideoksi zanjirini tugatish usulining asosini tashkil qiladi DNK ketma-ketligi , bu haqda Frederik xabar berdi Sanger va uning jamoasi 1977 yilda oldingi ishlarning davomi sifatida.

Bundan tashqari, nima uchun NGS Sangerdan yaxshiroq?

Sanger ketma-ketlik bir vaqtning o'zida faqat bitta fragmentni ketma-ketlashtirishi mumkin. Chunki NGS millionlab DNK qismlarini bog'lashi mumkin bo'lgan oqim hujayralaridan foydalanadi, NGS bir vaqtning o'zida barcha ketma-ketliklarni o'qiy oladi. Ushbu yuqori o'tkazuvchanlik xususiyati katta miqdordagi DNKni ketma-ketlashtirishda uni juda tejamkor qiladi.

Sanger ketma-ketligi uchun nima kerak?

uchun ingredientlar Sanger ketma-ketligi Ularga quyidagilar kiradi: A DNK polimeraza fermenti. Bir ipli qisqa bo'lak bo'lgan primer DNK bu shablonga bog'lanadi DNK va polimeraza uchun "boshlovchi" vazifasini bajaradi. To'rt DNK nukleotidlar (dATP, dTTP, dCTP, dGTP)

Tavsiya: