Sanger sekvensiyasi qanchalik aniq?
Sanger sekvensiyasi qanchalik aniq?

Video: Sanger sekvensiyasi qanchalik aniq?

Video: Sanger sekvensiyasi qanchalik aniq?
Video: Димаш - Беседа с учителем / Dear Светлана, которая едет на «Песню года» 2020 2024, Noyabr
Anonim

Sanger ketma-ketligi 99,99% bilan aniqlik klinik tadqiqotlar uchun "oltin standart" hisoblanadi ketma-ketlik . Biroq, yangi NGS texnologiyalari yuqori o'tkazuvchanlik qobiliyati va har bir namuna uchun arzonligi tufayli klinik tadqiqot laboratoriyalarida keng tarqalgan.

Bundan tashqari, nima uchun NGS Sangerdan yaxshiroq?

Sanger ketma-ketlik bir vaqtning o'zida faqat bitta fragmentni ketma-ketlashtirishi mumkin. Chunki NGS millionlab DNK qismlarini bog'lashi mumkin bo'lgan oqim hujayralaridan foydalanadi, NGS bir vaqtning o'zida barcha ketma-ketliklarni o'qiy oladi. Ushbu yuqori o'tkazuvchanlik xususiyati katta miqdordagi DNKni ketma-ketlashtirishda uni juda tejamkor qiladi.

Bundan tashqari, Sanger ketma-ketligi nimada? Sanger ketma-ketligi in vitro DNK replikatsiyasi jarayonida zanjirni tugatuvchi dideoksinukleotidlarning DNK polimeraza tomonidan tanlab qo'shilish jarayonidir; SNVlarni aniqlashning eng keng tarqalgan usuli hisoblanadi.

Keyinchalik, Sanger sekvensiyasi va keyingi avlod sekvensiyasi o'rtasidagi farq nima?

Keyingi - avlodlar ketma-ketligi (NGS) texnologiyalari o'xshash. Tanqidiy Sanger ketma-ketligi o'rtasidagi farq va NGS ketma-ketlik tovush Qachonki Sanger faqat usul ketma-ketliklar bir vaqtning o'zida bitta DNK fragmenti, NGS massiv ravishda parallel, ketma-ketlik har bir ishga bir vaqtning o'zida millionlab fragmentlar.

Zanjirni tugatish tartibi qanday ishlaydi?

Sanger DNK ketma-ketlik nomi bilan ham tanilgan zanjir - tugatish usuli ketma-ketlik . ddNTPlar natijasida tugatish ddNTPlarda nukleotidlar o'rtasida fosfodiester bog'lanish hosil bo'lishi uchun zarur bo'lgan 3'-OH guruhi yo'qligi sababli DNK zanjiri. Ushbu rishtasiz, zanjir hosil bo'ladigan nukleotidlar soni tugatilgan.

Tavsiya: